负责机关日常运转，承担文秘、信息、政务公开、信访、会务、机要、保密、档案、安全、后勤、宣传等工作。负责组织全局性调研活动。组织起草综合性材料、重要文件。负责建议提案、领导重要批示件督办工作。负责部门预决算、国有资产管理、政府采购监督管理、绩效评价和内部审计工作，承担机关和直属单位财务工作。参与专项转移支付资金管理工作。负责机关和直属单位干部人事管理、机构编制、离退休干部服务管理等工作。负责所属事业单位专业技术人员、职工队伍管理和行业技能鉴定工作。负责水产改制企业后续人事退休办理、离退休干部服务管理工作。负责机关和直属单位党风廉政建设和宣传思想政治工作。组织制定全市港航口岸和渔业管理政策、法制建设规划，指导协调港航与渔业执法监督检查。负责规范性文件草案起草、对外合同的合法性审核、重大执法决定法制审核工作。承担行政复议、行政应诉等工作。负责港航与渔业执法人员的培训和本局的普法教育工作。