主要职责是：

（一）承担综合行使港航、海洋和渔业综合行政执法职责。

（二）按权限组织开展全市港航、海洋和渔业水域的巡航监视；参与国家、省、台州市维护港航、海洋和渔业权益的执法工作。

（三）承担全市水路运政、航道行政、渔业资源保护、渔船渔港和渔业安全生产、水产养殖和初级水产品质量安全、水生野生动物保护、水产种质资源管理等执法工作；承担渔事纠纷调查，查处渔业违法案件；配合台州市港航管理部门开展港口行政执法工作。

（四）按权限承担海洋资源开发利用等方面行政执法任务，查处涉海违法案件。

（五）承担港航、海洋和渔业综合行政执法相关法制建设的具体工作。

（六）协助开展海上渔船或渔业抢险救助，配合做好渔港和渔业水域生态环境污染的调查处理，参与渔船水上交通与生产事故调查处理，协助开展渔场修复振兴工作。

（七）完成市委、市政府交办的其他任务。